Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Smim3Q99PE5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim3Q99PE5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms