Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atoh8Q99NA2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atoh8Q99NA2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms