Protein–RNA interactions for Protein: Q99N96

Mrpl1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl1Q99N96 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl1Q99N96 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl1Q99N96 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl1Q99N96 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl1Q99N96 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mrpl1Q99N96 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms