Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ms4a4dQ99N05 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms