Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd1Q99MV1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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Tdrd1Q99MV1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Tdrd1Q99MV1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Tdrd1Q99MV1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Tdrd1Q99MV1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Tdrd1Q99MV1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd1Q99MV1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.4 ms