Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp4Q99ME9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gtpbp4Q99ME9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms