Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fars2Q99M01 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fars2Q99M01 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms