Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnpo2Q99LG2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnpo2Q99LG2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms