Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp16Q99LG0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp16Q99LG0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms