Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Abcf2Q99LE6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Abcf2Q99LE6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms