Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gps1Q99LD4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gps1Q99LD4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms