Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TriobpQ99KW3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TriobpQ99KW3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms