Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PpifQ99KR7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PpifQ99KR7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms