Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lactb2Q99KR3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lactb2Q99KR3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms