Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Reep3Q99KK1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms