Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dctn2Q99KJ8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms