Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lims1Q99JW4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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