Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krcc1Q99JT5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krcc1Q99JT5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms