Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apobec3Q99J72 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms