Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clip1Q922J3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clip1Q922J3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms