Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Smarca5Q91ZW3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms