Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atpaf2Q91YY4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atpaf2Q91YY4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms