Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fyco1Q8VDC1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms