Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rapgef3Q8VCC8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms