Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trpm8Q8R4D5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trpm8Q8R4D5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms