Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3C1

Uncharacterized protein C2orf42 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8R3C1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8R3C1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8R3C1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8R3C1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms