Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1L4

Kdelr3, ER lumen protein-retaining receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr3Q8R1L4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Kdelr3Q8R1L4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Kdelr3Q8R1L4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms