Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Treml1Q8K558 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Treml1Q8K558 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms