Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lin28aQ8K3Y3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms