Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P0

Sdr9c7, Short-chain dehydrogenase/reductase family 9C member 7, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr9c7Q8K3P0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sdr9c7Q8K3P0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms