Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MyripQ8K3I4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms