Protein–RNA interactions for Protein: Q8K214

Scmh1, Polycomb protein SCMH1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scmh1Q8K214 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scmh1Q8K214 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scmh1Q8K214 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scmh1Q8K214 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scmh1Q8K214 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scmh1Q8K214 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scmh1Q8K214 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scmh1Q8K214 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms