Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Polr1eQ8K202 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms