Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms