Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hpf1Q8CFE2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hpf1Q8CFE2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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