Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
9030612E09RikQ8CE20 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
9030612E09RikQ8CE20 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms