Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms