Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sfrp1Q8C4U3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms