Protein–RNA interactions for Protein: Q8C460

Eri3, ERI1 exoribonuclease 3, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri3Q8C460 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Eri3Q8C460 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Eri3Q8C460 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Eri3Q8C460 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Eri3Q8C460 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Eri3Q8C460 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eri3Q8C460 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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