Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc90bQ8C3X2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms