Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TiparpQ8C1B2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TiparpQ8C1B2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms