Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FarsaQ8C0C7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FarsaQ8C0C7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FarsaQ8C0C7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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