Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sall4Q8BX22 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sall4Q8BX22 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms