Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ube3dQ8BX13 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ube3dQ8BX13 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ube3dQ8BX13 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ube3dQ8BX13 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ube3dQ8BX13 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ube3dQ8BX13 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ube3dQ8BX13 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ube3dQ8BX13 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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