Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Cxcl16Q8BSU2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cxcl16Q8BSU2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cxcl16Q8BSU2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms