Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rhbdd3Q8BP97 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rhbdd3Q8BP97 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms