Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8BGC1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms