Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms