Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trmt12Q8BG71 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms