Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms